来自韩国国立大学、英国剑桥大学和美国理海大学的研究人员携手开发了最新模型。研究发表于最新一期《物理化学B杂志》。
刺突蛋白是新冠病毒用来与受体结合的主要表面蛋白,当刺突蛋白与人类细胞受体结合后,病毒膜与人类细胞膜融合,使得病毒基因组得以进入人类细胞并开始感染。
研究人员用冷冻电镜测定了刺突蛋白的结构,但这一模型有许多丢失的氨基酸残基。因此,他们首先对缺失的残基进行建模,然后对其他缺失的域进行建模。此外,他们也对附着于刺突蛋白的所有潜在聚糖(或碳水化合物)进行了建模。这些聚糖会阻止抗体识别出刺突蛋白,加大疫苗研发的难度。他们还创建出了刺突蛋白的病毒膜系统,用于分子动力学模拟。
里海大学生物科学和生物工程学系教授尹元弼(音)说:“我们的模型是首个完全糖基化、全链新冠病毒刺突蛋白开源模型,科学家可以使用我们的模型,针对新冠肺炎防治方法开展富有创新性的模拟研究。”